四重PCR检测副溶血性弧菌及其毒力基因方法的建立


    微生物学通报 Nov 20 2016 43(11) 2521−2529
    Microbiology China httpjournalsimaccnwswxtbcn
    tongbao@imaccn DOI 1013344jmicrobiolchina151066


    Foundation item Natural Science Foundation of Fujian Province (No 2015J01614) Marine Economy Innovation
    Development Regional Demonstration Foundation of Xiamen (No13PZP002SF24)
    *Corresponding author Tel 865926181487 Email chyizhou@163com
    Received December 27 2015 Accepted May 23 2016 Published online (wwwcnkinet) May 24 2016
    基金项目:福建省然科学基金项目(No 2015J01614)厦门市海洋济创新发展区域示范项目(No13PZP002SF24)
    *通讯作者:Tel:865926181487Email:chyizhou@163com
    收稿日期:20151227接受日期:20160523优先数字出版日期(wwwcnkinet):20160524
    生物实验室
    四重 PCR 检测副溶血性弧菌毒力基方法建立
    林佳琪 1 苏国成 12 黄建炜 3 陈泽辉 3 周常义 12*
    (1 集美学食品生物工程学院 福建 厦门 361021)
    (2 厦门市食品科技研发检测中心 福建 厦门 361021)
    (3 厦门市疾病预防控制中心 福建 厦门 361021)


    摘 :目建立时检测副溶血性弧菌 toxRtdhtrhtlh 基四重 PCR 快速检测方
    法方法分副溶血性弧菌 toxRtdhtrhtlh 4 基靶基设计 4 特异性引
    物 4 引物浓度退火温度进行优化获佳引物例扩增条件建立快速检测致病
    性副溶血性弧菌四重 PCR 体系通特异性验证灵敏度验证模拟样品检测进行方法
    确认结果四重 PCR 体系扩增条带预期相符 115 bp (toxR)244 bp (tdh)418 bp (trh)
    759 bp (tlh) 4 目条带 74 株副溶血性弧菌 37 株非目标菌测试结果表明建立
    方法良特异性该方法模板 DNA 检测灵敏度 50 μgL纯培养物检测灵敏度
    67×103 CFUmL副溶血性弧菌含量 136 CFUg 工模拟样品增菌 6 h toxRtlhtdh
    trh 4 基时检出结该方法实现时检测携带 toxRtdhtrhtlh 4 种基
    副溶血性弧菌开展致病性副溶血性弧菌检测研究具定现实意义
    关键词:副溶血性弧菌四重 PCRtoxR 基tdh 基trh 基tlh 基
    Establishment of a quadruple PCR method for detecting pathogenic
    genes in Vibrio parahaemolyticus
    LIN JiaQi1 SU GuoCheng12 HUANG JianWei3 CHEN ZeHui3 ZHOU ChangYi12*
    (1 College of Food and Bioengineering Jimei University Xiamen Fujian 361021 China)
    (2 Xiamen Food Research and Inspection Centre Xiamen Fujian 361021 China)
    (3 Xiamen Centre for Disease Control and Prevention Xiamen Fujian 361021 China)
    Abstract [Objective] This study aimed at establishment of a rapid specific quadruple PCR assay for
    detecting Vibrio parahaemolyticus and its virulence genes [Methods] Four pairs of primers were
    designed based on toxR tdh trh and tlh genes sequences of V parahaemolyticus Optimized the
    concentration of four pairs of primers and the annealing temperature to obtain the best ratio of primer
    and amplification conditions the rapid quadruple PCR detection of pathogenic V parahaemolyticus
    was established The specificity and sensitivity of the quadruple PCR method were also evaluated 2522 微生物学通报 Microbiol China 2016 Vol43 No11

    Tel 01064807511 Email tongbao@imaccn httpjournalsimaccnwswxtbcn
    [Results] The expected sizes of amplification bands were 115 bp 244 bp 418 bp and 759 bp for
    toxR tdh trh and tlh respectively The highly specificity of this method was evaluated by using 74 V
    parahaemolyticus strains and 37 nontargeted bacteria The detection limits of the multiplex PCR for
    DNA was 50 μgL Detection sensitivity of V parahaemolyticus in pure culture condition was
    67×103 CFUmL Four targeted fragments were detected in artificially contaminated seafood with
    136 CFUg V parahaemolyticus after 6 h enrichment [Conclusion] The multiplexPCR method can
    simultaneously detect V parahaemolyticus with toxR tdh trh andor tlh It is of certain significance
    to carry out the detection of pathogenic V parahaemolyticus
    Keywords Vibrio parahaemolyticus Quadruple PCR toxR gene tdh gene trh gene tlh gene

    副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticusVp)
    海洋环境中然存种嗜盐革兰氏阴性细
    菌够盐度温度环境中生存[12]
    广泛存海口江口浮游生物鱼类虾
    类贝类等水产品中[34]海国家普遍存食
    源性致病菌[59]副溶血性弧菌通消费者
    摄入生未煮熟海产品引起发热腹痛腹泻
    恶心呕吐等急性胃肠炎症状严重时甚导致昏迷
    休克死亡然界中存副溶血性弧菌部分
    非致病仅 03−50携带致病子[1011]
    国 2014 年 6 月 1 日开始采新版 GB
    478972013该标准中检验程序然需采传
    统培养法进行增菌分离培养生化鉴定神奈川
    试验血清学试验整检测程存工作量
    检测周期长工作繁琐操作判定容易成
    高等缺陷行业标准 SNT 24242010 SNT
    26412010SNT 25642010 SNT 275452011
    采分子生物学技术进行副溶血性弧菌检测
    判断携带致病基类型
    重 PCR 技术(Multiplex PCR)常规 PCR
    基础发展起种高效快速分子生物学技
    术反应体系中加入引物够
    时进行扩增目片段简化工
    作流程降低实验成快速效达
    量样分析鉴定研究前期床致病副
    溶血性弧菌研究基础选取副溶血性弧菌
    toxRtdhtrhtlh 基设计 4 特异性引物
    通优化引物浓度例退火温度等条件建立
    PCR 反应体系中时扩增 toxRtdhtrh
    tlh 4 种目标基四重 PCR 方法
    1 材料方法
    11 实验菌株
    32 株致病性副溶血性弧菌厦门市疾病预防
    控制中心提供均食物中毒分离株菌株编号
    VP1−VP8VP42VP60VP64VP67−VP71VP75
    VP87−VP93 VP170 VP171 VP183−VP187
    VP201102941 株副溶血性弧菌菌株实验室
    食品环境中分离保存菌株菌株编号
    VPS201306 VPS201307 VPZ1432−VPZ1444
    VPZ1451−VPZ1465 VPZ1539 VPZ1550
    VPZ1555VPH1602−VPH16091 株标准菌株副溶
    血性弧菌(ATCC 17802)厦门市食品科技研发检
    测中心提供
    22 株非副溶血性弧菌分溶藻弧菌河弧
    菌创伤弧菌拟态弧菌弗氏弧菌哈维弧菌
    非 O1 型霍乱弧菌鳗弧菌嗜水气单胞菌发光
    杆菌嗜盐单胞菌实验室保存菌株
    15 株非副溶血性弧菌标准菌株分金黄色
    葡萄球菌(ATCC 25923)肠埃希氏菌(ATCC
    25922)肠埃希氏菌 O157:H7 (NCTC 12900)
    乙型溶血性链球菌(ATCC 21059)产气肠杆菌
    (ATCC 13048) 甲型副伤寒沙门菌
    (CMCC(B)50093) 乙型副伤寒氏沙门菌
    (CMCC(B)50094)鼠伤寒沙门氏菌(ATCC 14028)
    肠结肠炎耶尔森氏菌[CMCC(B)52204]单增李斯
    特菌(ATCC 19115)伊氏李斯特菌(STCC 19119)
    英诺克李斯特菌(ATCC 33090)阪崎肠杆菌(ATCC
    29544)粪链球菌(ATCC 29212)宋志贺氏菌林佳琪等 四重 PCR 检测副溶血性弧菌毒力基方法建立 2523

    Tel 01064807511 Email tongbao@imaccn httpjournalsimaccnwswxtbcn
    [CMCC(B) 51592]厦门市食品科技研发检测中
    心提供
    12 试剂仪器
    DNA 基组提取试剂盒DNA Marker购
    天根生化科技(北京)限公司Multiplex PCR
    Assay Kit Ver2购宝生物工程(连)限公司
    琼脂糖 Biowest Agarose G10购西班牙 Biowest
    公司GelStain 购北京全式金生物技术限公司
    LifeEco 基扩增仪BIOER 公司微量紫外
    分光光度计 Q5000Quawell 公司凝胶成仪
    GenoSens1860海勤翔科学仪器限公司掌
    离心机 D1008ESCILOGEX 公司水电泳
    槽Power B 基础型电泳电源北京凯元信瑞仪器
    限公司
    13 培养基
    弧菌培养基 3 NaClAPWTCBS参
    GB478972013 配制菌培养基常规培养
    基均购广东环凯微生物科技限公司
    14 引物设计合成
    利分子信息学方法根 NCBI GenBank
    中已发表副溶血性弧菌跨膜调控蛋白 R 基
    (Transmembrane regulatory protein RtoxR)耐热直
    接溶血素毒素基(Thermostable direct hemolysin
    tdh) 耐热直接溶血素毒素相关毒素基
    (Thermostable direct haemolysinrelated haemolysin
    trh) 耐热溶血毒素基(Thermolabile
    hemolysintlh)序列采 DNAMAN 软件中
    Alignment 进行序列确定序列保守片
    段利 Primer Premier 50 设计引物利
    MFEprimer20 线软件进行引物间二聚体验证
    利 BLAST 进行引物特异性验证引物海英
    潍捷基公司合成(表 1)
    15 基组 DNA 制备
    基组 DNA 提取试剂盒进行副溶血性弧
    菌 DNA 提取测量 DNA 含量 TE 溶液稀释
    50 mgL提取基组 DNA 置−20 °C
    保存
    16 纯菌悬液 DNA 模板提取
    菌条件取副溶血性弧菌单菌落接种 3
    表 1 引物序列扩增产物
    Table 1 Primer sequence and amplicon size
    Target
    gene
    Primer
    name
    Primer sequence
    (5′→3′)
    Amplicon
    size (bp)
    toxR vptoxR2f GTTCCAAAACGAGGCTATCA 115
    vptoxR2r CAGAGGCGTCAATGTAATC
    AG
    tdh vptdh1f CTTCCATCTGTCCCTTTTCC 244
    vptdh1r CCGCTGCCATTGTATAGTCT
    trh vptrh3f TTTCCTTCTCCTGGTTCCG 418
    vptrh3r TATGTCCATTGCCGCTCT
    tlh vptlh4f CGAAGAGCCAACCTTATCA 759
    vptlh4r TCCGTCAAACGAATCAGTG


    NaClAPW 中37 °C200 rmin 条件培养 6 h
    菌生理盐水菌液进行 10 倍梯度稀释选择
    合适稀释度菌悬液 TCBS 板计数稀
    释度菌悬液取 1 mL12 000 rmin 离心 5 min
    清菌生理盐水重悬 110 原体积
    100 °C 沸水水浴 10 min细菌细胞裂解然立
    放入 4 °C 冷 5 min12 000 rmin 离心 3 min
    取清备
    17 四重 PCR 体系建立
    通单重 PCR 体系退火温度优化
    重 PCR 体系中引物浓度例退火温度优
    化反应体系(50 μL PCR 体系)包括:2×Multiplex
    PCR Buffer (Mg2+dNTP plus) 25 μLMultiplex PCR
    Enzyme Mix 03 μL模板 5 μLvptrh3f3r
    vptdh1f1rvptoxR2f2rvptlh4f4r 2 μL 菌
    ddH2O 补足 50 μL中 4 游引物浓度
    例通参数优化确定 trhtdhtoxRtlh
    序次进行二重三重四重组合引物浓度分
    :trh 引物终浓度 04 μmolLtdh 引物终浓度 02
    010067005004003 μmolLtoxR 引物终
    浓度 02016012008006004 μmolLtlh
    引物终浓度 02016012008006004 μmolL
    PCR 反应条件:94 °C 1 min94 °C 30 s46 °C
    45 s72 °C 1 min35 循环72 °C 10 min4 °C
    保存取 8 μL 扩增产物 15琼脂糖凝胶进2524 微生物学通报 Microbiol China 2016 Vol43 No11

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    行电泳凝胶成仪进行观察拍
    18 四重 PCR 体系灵敏度试验
    181 基组 DNA 灵敏度检测: 15 获副溶
    血性弧菌基组 DNA 溶液菌核酸水
    DNA 溶液稀释 50×104 50×103 50×102
    50×10150×10050×10−1 μgL稀释 DNA
    溶液作模板进行四重 PCR 体系灵敏度检测
    182 纯培养菌液灵敏度检测: 16 获纯副溶
    血性弧菌稀释度菌悬液 DNA 模板菌悬
    液进行板计数时 DNA 模板加入四重 PCR
    体系根板计数结果应四重 PCR 检测结
    果计算方法细菌灵敏度
    19 四重 PCR 体系特异性试验
    副溶血性弧菌非副溶血性弧菌菌株
    增菌提取 DNA取 1 μL 进行四重 PCR 检测
    110 工污染样品检测
    取 GB 478972013 方法验证副溶血性
    弧菌牡蛎虾鱿鱼带鱼等样品菌条件
    称取 25 g 均质杯中加入 225 mL 3
    NaClAPW 培养液均质器进行均质制匀浆
    添加 136 CFUg 溶血性弧菌悬液时菌生
    理盐水做空白添加副溶血性弧菌样品
    基质制备模拟样品置 36 °C200 rmin 培
    养 6 h 取 1 mL1 000 rmin 离心 10 min 取
    清10 000 rmin 离心 10 min 清生理盐水
    洗涤 2 遍提取菌液 DNA 进行四重 PCR 检测
    2 结果
    21 四重体系中单重PCR四重PCR实验
    结果
    目片段进行单重梯度 PCR 115244
    418759 bp 处分扩增出 toxRtdhtrhtlh 基
    相应目条带优化四重 PCR 体系引物
    浓度退火温度终确定引物加入终
    浓度:vptrh3f3r 终浓度 04 μmolLvptdh1f1r 终浓
    度 004 μmolLvptoxR2f2r 终浓度 008 μmolL
    vptlh4f4r 终浓度 004 μmolL (图 1)退火温度
    45−574 °C 成功扩增出清晰目条带(图 2)
    四重 PCR 体系 4 扩增条带单重 PCR
    体系 4 扩增条带致


    图 1 重 PCR 引物浓度优化结果
    Figure 1 Optimization results of different primers concentrations for multiple PCR
    注:A:trhtdh 基双重 PCR 引物优化结果(M:D2000 DNA marker1−6:trh 引物浓度均 04 μmolLtdh 引物浓度次 02
    010067005004003 μmolL)B:trhtdhtoxR 基三重 PCR 引物浓度优化结果(M:D2000 DNA marker1−6:trh 引
    物浓度均 04 μmolLtdh 引物浓度均 004 μmolLtoxR 引物浓度次 02016012008006004 μmolL)C:trh
    tdhtoxRtlh 基四重 PCR 引物浓度优化结果(M:D2000 DNA marker1−6:trh 引物浓度均 04 μmolLtdh 引物浓度均
    004 μmolLtoxR 引物浓度均 008 μmolLtlh 引物浓度次 02016012008006004 μmolL)D:引物进行单重
    PCR 四重 PCR 扩增结果(M:D2000 DNA marker1:toxR 单重 PCR 结果2:tdh 单重 PCR 结果3:trh 单重 PCR 结果4:
    tlh 单重 PCR 结果5:toxRtdhtrhtlh 四重 PCR 结果6:空白)
    Note A Optimization results of primers concentration for duplex PCR (M D2000 DNA marker 1−6 trh (04 μmolL) and the
    concentrations of tdh are 02010067005004003 μmolL) B Optimization results of primers concentration for triplex PCR (M
    D2000 DNA marker 1−6 trh (04 μmolL) tdh (004 μmolL) and the concentrations of toxR are 02 016 012 008 006 004 μmolL) C
    Optimization results of primers concentration for quadruple PCR (M D2000 DNA marker 1−6 trh (04 μmolL) tdh (004 μmolL) toxR
    (008 μmolL) and the concentrations of tlh are 02 016 012 008 006 μmolL 004 μmolL) D Products of single PCR and
    multiplexPCR (M D2000 DNA marker 1 Single PCR product of toxR 2 Single PCR product of tdh 3 Single PCR product of trh 4
    Single PCR product of tlh 5 MultiplexPCR products of toxR tdh trh tlh 6 Blank control)
    Enterobacter sakazakii Streptococcus faecalis Shigella sonnei + Positive – Negative
    Salmonella paratyphi B Salmonella typhimurium Yersinia enterocolitica Listeria monocytogenes Listeria ivanovii Listeria innocua
    H7 beta hemolytic streptococcus Enterobacter aerogenes Salmonella paratyphi A׃aureus Escherichia coli Escherichia coli O157
    Vibrio harveyi nonO1 Vibrio cholerae Vibrio anguillarum Aeromonas hydrophila Photorhabdus spp Halomonas sp Staphylococcus
    Note * NonVibrio parahaemolyticus including Vibrio alginolyticus Vibrio fluvialis Vibrio vulnificus Vibrio mimicus Vibrio furnissii
    斯特菌阪崎肠杆菌粪链球菌宋志贺氏菌 +:阳性–:阴性
    甲型副伤寒沙门氏菌乙型副伤寒沙门氏菌鼠伤寒沙门氏菌肠结肠炎耶尔森氏菌单增李斯特菌伊氏李斯特菌英诺克李
    H7乙型溶血性链球菌产气肠杆菌׃水气单胞菌发光杆菌嗜盐单胞菌金黄色葡萄球菌肠埃希氏菌肠埃希氏菌 O157
    注:*:非副溶血性弧菌包括:溶藻弧菌河弧菌创伤弧菌拟态弧菌弗氏弧菌哈维弧菌非 O1 型霍乱弧菌鳗弧菌嗜
    NonVibrio parahaemolyticus* – – – –
    Vibrio parahaemolyticus No Z1433 + – – –
    + – – +
    H1603 H1605−H1609 Z1451−Z1465
    Vibrio parahaemolyticus No Z1432 Z1434 Z1435 Z1437−Z1439 Z1441−Z1444 H1602
    Vibrio parahaemolyticus No 186 187 S201306 S201307 ATCC 17802 + – + +
    Vibrio parahaemolyticus No 87−93 64 170 171 Z1555 Z1436 Z1440 + + + +
    Vibrio parahaemolyticus No 1−8 42 60 67−71 75 183−185 2011029 Z1539 Z1550 H1604 + + – +
    toxR tdh trh tlh
    Target gene
    Bacterial specie and strain ID
    Table 2 The specificity results of multiple PCR
    表 2 四重 PCR 体系特异性试验结果

    模板 DNA 浓度检测限 50 μgL
    toxR 携带 tdhtrhtlh 致病子副溶血性弧菌
    扩增产物(图 3)时检测副溶血性弧菌
    明显扩增出模板 DNA 50 μgL 时未见
    模板 DNA 稀释 50 μgL 时4 条目条带
    231 基组 DNA 灵敏度试验结果:试验测定
    23 四重 PCR 体系灵敏度试验结果
    血性弧菌致病子
    性基tdhtrhtlh 3 引物分鉴副溶
    高度特异性toxR 作副溶血性弧菌种特异
    条带研究证明该四重 PCR 体系中 4 引物具
    血性弧菌均扩增出相应 toxRtdhtrhtlh
    标 FDA 2004 标准[12]检测结果致非副溶
    toxR扩增结果实验室荧光定量 PCR 验证国
    VPZ1451–VPZ1465 携带 toxRtlhVPZ1433 携带
    VPH1603 VPH1605−VPH1609
    VPZ1437−PZ1439VPZ1441−VPZ1444VPH1602
    trh tlh VPZ1432 VPZ1434 VPZ1435
    VPS201306VPS201307 ATCC 17802 携带 toxR
    Z1440 携带 toxRtdhtrhtlhVP67−71
    VP87–93VP64VP170VP171PZ1555Z1436
    VPZ1539VPZ1550 VPH1604 携带 toxtdhtlh
    (表 2)VP1−22VP42VP60VP75VP2011029
    非副溶血性弧菌进行重 PCR 扩增试验结果显示
    特异性扩增致病性副溶血性弧菌
    测序结果表明建立 4 基目片段均
    扩增产物送英潍捷基(海)贸易限公司测序
    4 基单重 PCR 重 PCR 产物电泳
    22 四重 PCR 体系特异性试验结果

    535 °C 5 574 °C 6 596 °C
    Note M D2000 DNA marker 1 450 °C 2 460 °C 3 489 °C 4
    for quadruple PCR
    Figure 2 Optimization results of annealing temperature
    图 2 四重 PCR 退火温度优化结果



    Tel 01064807511 Email tongbao@imaccn httpjournalsimaccnwswxtbcn

    林佳琪等 四重 PCR 检测副溶血性弧菌毒力基方法建立 25252526 微生物学通报 Microbiol China 2016 Vol43 No11

    Tel 01064807511 Email tongbao@imaccn httpjournalsimaccnwswxtbcn



    图 3 四重 PCR 基组 DNA 灵敏度试验结果
    Figure 3 The sensitivity results of genome DNA template
    concentration for quadruple PCR
    注:M:D2000 DNA marker1−6:DNA 模板浓度次 50×104
    50×10350×10250×10150×10050×10−1 μgL
    Note M D2000 DNA marker 1−6 The concentrations of genome
    DNA are 50×104 50×103 50×102 50×101 50×100
    50×10−1 μgL

    232 纯培养菌液灵敏度试验结果:副溶血性弧
    菌培养液富集培养菌生理盐水
    10 倍梯度稀释分进行菌落计数重 PCR 检
    测检测结果表明副溶血性弧菌模板含量
    67×103 CFUmL 时4 目片段够时检出
    (图4)副溶血性弧菌模板含量67×102 CFUmL
    时 tdhtrh 2目片段检出该方
    法检出灵敏度 67×103 CFUmL



    图 4 四重 PCR 副溶血性弧菌纯培养液灵敏度试验结果
    Figure 4 The sensitivity results of pure culture for
    quadruple PCR
    注:M:D2000 DNA marker1−7:菌液浓度次 67×106
    67×10567×10467×10367×10267×10167×100 CFUmL
    Note M D2000 DNA marker 1−7 The cell concentrations of
    pure culture are 67×106 67×105 67×104 67×103 67×102
    67×101 67×100 CFUmL
    24 模拟样品检测基携带判定
    通副溶血性弧菌水产品样品中加入
    副溶血性弧菌菌液液体培养基富集培养取
    适量样品进行重 PCR 反应检测时做空白
    副溶血性弧菌含量 136 CFUg 模拟样品
    富集 6 h toxRtdhtrhtlh 4 目条带均成
    功扩增出条带清晰方法判定样品
    否含副溶血性弧菌时检测携带 tdhtrh
    tlh 致病基情况
    3 讨
    31 关种特异基毒力基讨
    tdhtrhtlh 基毒力调控基 toxR 致病
    性副溶血性弧菌研究中重毒力子[1323]tdh
    基 trh 基分表达耐热直接溶血素毒素耐
    热直接溶血素毒素相关毒素tlh 基表达耐热溶
    血毒素种非典型磷脂酶床分离株
    环境分离株数副溶血弧菌均携带 tlh 基
    床分离株携带 tdh 基环境分离株
    水产品分离株极少携带 tdh 基[23]床株环
    境株检出率 trh 基较低 tdh 基存
    情况[24]目前鉴副溶血性弧菌目基
    toxRpR72HtlhgyrB vpm[72527]tlh 基
    副溶血性弧菌中出现频率高
    部分研究员认副溶血性弧菌种特异性基
    Klein 研究表明 tlh 基弧菌属中副溶
    血性弧菌外占较高例相似性较高[28]
    West 等赞成 tlh 基作副溶血性弧菌
    种特异基[29]研究者发现toxR 基灵
    敏度高分子方法鉴定副溶血性弧菌 tlh
    gyrBpR72H 更[3031]团队 2005−2011 年
    厦门市床致病副溶血性弧菌研究表明食物中
    毒副溶血性弧菌分离株均携带toxR基tlh基
    tdh 基携带率 8496−8520trh 基携
    带率 796[3233]实现食品中致病性林佳琪等 四重 PCR 检测副溶血性弧菌毒力基方法建立 2527

    Tel 01064807511 Email tongbao@imaccn httpjournalsimaccnwswxtbcn
    副溶血性弧菌快速筛查研究副溶血性弧菌
    toxRtdhtrhtlh 4 基建立四重 PCR 方法
    副溶血性弧菌毒力基检测
    32 关重PCR重荧光定量 PCR讨
    重 PCR 实现时检测重致病菌
    实现时检测种菌基提高通
    量节省样品提高成国外研究员针
    副溶血性弧菌检测研究中关
    重 PCR 应陈丽萍等建立时检测副溶血性弧
    菌 gyrasetdhtrh 基三重 PCR 快速检测方法
    动毛细电泳分析系统进行分析 PCR 产
    物基组 DNA 浓度 136 μgL纯培养条
    件菌浓度 66×102 CFUmL 时3 目基
    时检出[13]Hossain 等 groELtdh trh 建
    立三重 PCR实现总副溶血性弧菌携带致病子
    副溶血性弧菌快速检测研究低检出
    200 pg DNA[14]张捷等 F0F1ATPase 核心构建
    分子马达分进行副溶血性弧菌 tdhtrhtlh
    toxR 分子分型方法研究检测限达 10 pg反应
    需分逐进行分型[34]研究建立副溶血性
    弧菌四重 PCR 快速检测方法实现反应
    体系中 4 种分子分型检验四重体系含
    较组分目片段扩增反应相互受定
    影响检出限进步降低
    重荧光定量 PCR 检测灵敏度普通重
    PCR 检测灵敏度高 1−2 数量级许龙岩等建立
    副溶血性弧菌特异性检测 toxR 基 tdh 毒力基
    Taqman 探针荧光 PCR 检测方法[15]低检测
    浓度达 36×102 CFUmL张红芝等针 toxR
    tlh 基建立添加标 PCR成功排假阴性
    干扰[16] DNA 灵敏度检测限 05 μgL
    Garrido 等 tdhtrh 基建立双重荧光定量 PCR
    方法该方法 tdhtrh1trh2 检测限分
    6 CFU25 g11 CFU25 g8 CFU25 g[17]He 等
    toxRtdhtrh 基建立副溶血性弧菌致病子
    三重荧光定量 PCR 方法该方法低检测
    14 pg反应[18]重荧光定量 PCR 特异
    性探针加入体系中引物探针设计更
    复杂外荧光定量 PCR 试验耗材试剂
    实验设备相 PCR 试验言均较昂贵难
    基层实验室推广
    国外少研究种致病菌建立
    重 PCR 检测方法[3541]江迎鸿等[35]针扩增
    霍乱弧菌副溶血性弧菌单核细胞增生李斯特氏
    菌建立三重 PCR 检测方法Lee 等[36]肠杆菌
    蜡样芽胞杆菌副溶血性弧菌沙门氏菌单增李
    斯特菌金黄色葡萄球菌 6 种食源性致病菌建立
    重 PCR 方法Zhang 等[37]生鲜虾中副溶血性
    弧菌单增李斯特菌沙门氏菌建立重实时荧光
    定量 PCR 方法等等水产品进行副溶血性弧
    菌检测时发现海产品中副溶血性弧菌
    外携带致病菌研究建立副
    溶血性弧菌四重 PCR 快速检测方法具成低易
    操作等优点 PCR 反应体系中时检
    测副溶血性弧菌 4 毒力基种特异基
    致病性副溶血性弧菌快速筛查
    4 结
    通优化引物浓度退火温度研究建立
    副溶血性弧菌四重 PCR 体系中引物终浓度
    分:trh 04tdh 004toxR 008tlh 004 μmolL
    副溶血性弧菌模板 DNA 检测灵敏度
    50 μgL纯培养条件tdhtrhtlhtoxR 4
    基时检测灵敏度 67×103 CFUmLtdhtrh
    2 基时检测灵敏度 67×102 CFUmL副
    溶血性弧菌含量 136 CFUg 工模拟样品增
    菌6 h该体系检出副溶血性弧菌携带tdh
    trhtlhtoxR 基
    研究建立副溶血性弧菌四重 PCR 快速2528 微生物学通报 Microbiol China 2016 Vol43 No11

    Tel 01064807511 Email tongbao@imaccn httpjournalsimaccnwswxtbcn
    检测方法相传统培养方法具耗时短工
    作量等优点基层实验室开展副溶血性弧菌
    毒力基携带情况检测提供快速效方
    法规模样品检测食源性致病菌风险评估
    中具定潜应价值
    参 考 文 献
    [1] Young I Gropp K Fazil A et al Knowledge synthesis to support
    risk assessment of climate change impacts on food and water
    safety a case study of the effects of water temperature and
    salinity on Vibrio parahaemolyticus in raw oysters and harvest
    waters[J] Food Research International 2015 68 8693
    [2] Xu XK Wu QP Zhang JM et al Prevalence pathogenicity and
    serotypes of Vibrio parahaemolyticus in shrimp from Chinese
    retail markets[J] Food Control 2014 46 8185
    [3] Newton AE Garrett N Stroika SG et al Notes from the field
    increase in Vibrio parahaemolyticus infections associated with
    consumption of atlantic coast shellfish2013[J] Morbidity and
    Mortality Weekly Report 2014 63(15) 335336
    [4] Silvester R Alexander D Ammanamveetil MHA Prevalence
    antibiotic resistance virulence and plasmid profiles of Vibrio
    parahaemolyticus from a tropical estuary and adjoining
    traditional prawn farm along the southwest coast of India[J]
    Annals of Microbiology 2015 65(4) 21412149
    [5] Wu Y N Wen J Ma Y et al Epidemiology of foodborne disease
    outbreaks caused by Vibrio parahaemolyticus China
    20032008[J] Food Control 2014 46 19720
    [6] Mao XD Hu JF Liu XM Epidemiological characteristics of
    bacterial foodborne disease during the year 2003−2007 in
    China[J] Chinese Journal of Food Hygiene 2010 22(3) 224228
    (in Chinese)
    毛雪丹 胡俊峰 刘秀梅 2003−2007 年中国 1060 起细菌性食
    源性疾病流行病学特征分析[J] 中国食品卫生杂志 2010
    22(3) 224228
    [7] Letchumanan V Yin WF Lee LH et al Prevalence and
    antimicrobial susceptibility of Vibrio parahaemolyticus isolated
    from retail shrimps in Malaysia[J] Frontiers in Microbiology
    2015 6 33
    [8] Cruz C Hedderley D Fletcher GC et al LongTerm study of
    Vibrio parahaemolyticus prevalence and distribution in New
    Zealand shellfish[J] Applied and Environmental Microbiology
    2015 81(7) 23202327
    [9] Haendiges J Rock M Myers RA et al Pandemic Vibrio
    parahaemolyticus Maryland USA 2012[J] Emerging Infectious
    Diseases 2014 20(4) 718720
    [10] Han Y Zhang HY Ma SL et al Establishment of a fluorescent
    PCR method for pathogenic gene Vibrio parahaemolyticus
    strains[J] Chinese Journal of Food Hygiene 2013 25(5)
    397400 (in Chinese)
    韩玥 张惠媛 马师良 等 荧光 PCR 检测副溶血性弧菌致病
    基方法建立[J] 中国食品卫生杂志 2013 25(5) 397400
    [11] Anonymous ISOTS 2187212007 Microbiology of food and
    animal feeding stuffsHorizontal method for the detection of
    potentially enteropathogenic Vibrio spp Part 1 Detection of
    Vibrio parahaemolyticus and Vibrio cholerae[S] Geneva
    Switzerland ISO 2007
    [12] FDA BAM Bacteriological analytical manual chapter 9
    Vibrio[S] 7th Edition Washington DC Food and Drug
    Administration 2004
    [13] Chen LP Liu ZM Chen Y et al Specific multiplexPCR method
    for rapid detection of Vibrio parahaemolyticus[J] Microbiology
    China 2014 41(4) 764775 (in Chinese)
    陈丽萍 刘忠民 陈芸 等 特异性三重 PCR 快速检测副溶血
    性弧菌[J] 微生物学通报 2014 41(4) 764775
    [14] Hossain MT Kim YO Kong IS Multiplex PCR for the
    detection and differentiation of Vibrio parahaemolyticus strains
    using the groEL tdh and trh genes[J] Molecular and Cellular
    Probes 2013 27(56) 171175
    [15] Xu LY Yuan MY Cao JJ et al Detection of Vibrio
    parahaemolyticus using duplex fluorescence realtime PCR with
    TaqMan probe[J] Food Science 2013 34(18) 263266 (in
    Chinese)
    许龙岩 袁慕云 曹际娟 等 TaqMan 探针双重荧光 PCR 法检
    测副溶血性弧菌[J] 食品科学 2013 34(18) 263266
    [16] Zhang HZ Gu QF Liu H et al Development and evaluation of
    PCR with internal control in detecting Vibrio
    parahaemolyticus[J] Chinese Journal of Health Laboratory
    Technology 2011 21(4) 921924 (in Chinese)
    张红芝 顾芳 刘弘 等 副溶血性弧菌添加标 PCR
    检测方法建立评价[J] 中国卫生检验杂志 2011 21(4)
    921924
    [17] Garrido A Chapela MJ Ferreira M et al Development of a
    multiplex realtime PCR method for pathogenic Vibrio
    parahaemolyticus detection (tdh+ and trh+)[J] Food Control
    2012 24(12) 128135
    [18] He P Chen Z Luo J et al Multiplex realtime PCR assay for
    detection of pathogenic Vibrio parahaemolyticus strains[J]
    Molecular and Cellular Probes 2014 28(5) 246250
    [19] Chen SY Ge BL Development of a toxRbased loopmediated
    isothermal amplification assay for detecting Vibrio
    parahaemolyticus[J] BMC Microbiology 2010 10 41
    [20] RobertPillot A Copin S Gay M et al Total and pathogenic
    Vibrio parahaemolyticus in shrimp Fast and reliable
    quantification by realtime PCR[J] International Journal of Food
    Microbiology 2010 143(3) 190197
    [21] Yamazaki W Kumeda Y Misawa N et al Development of a
    loopmediated isothermal amplification assay for sensitive and
    rapid detection of the tdh and trh genes of Vibrio
    parahaemolyticus and related Vibrio Species[J] Applied and
    Environmental Microbiology 2010 76(3) 820828
    [22] Sun W Zhang YY Ju XM et al Electrochemical
    deoxyribonucleic acid biosensor based on carboxyl functionalized
    graphene oxide and polyllysine modified electrode for the
    detection of tlh gene sequence related to Vibrio
    parahaemolyticus[J] Analytica Chimica Acta 2012 752 3944
    [23] Xian YY Yi MY Wei S et al Novel Multiplex polymerase chain
    reaction Assay to detect virulencerelated genes in Vibrio
    parahaemolyticus[J] Modern Food Science and Technology
    2015 31(7) 309315 (in Chinese)
    冼钰茵 易敏英 魏霜 等 基弧菌毒力基重 PCR 法
    建立副溶血弧菌毒力基检测中应[J] 现代食品
    科技 2015 31(7) 309315
    [24] Theethakaew C Feil EJ CastilloRamírez S et al Genetic
    relationships of Vibrio parahaemolyticus isolates from clinical
    human carrier and environmental sources in Thailand determined
    by multilocus sequence analysis[J] Applied and Environmental
    Microbiology 2013 79(7) 23582370
    [25] Suffredini E Cozzi L Ciccaglioni G et al Development of a
    colony hybridization method for the enumeration of total and
    potentially enteropathogenic Vibrio parahaemolyticus in
    shellfish[J] International Journal of Food Microbiology 2014 林佳琪等 四重 PCR 检测副溶血性弧菌毒力基方法建立 2529

    Tel 01064807511 Email tongbao@imaccn httpjournalsimaccnwswxtbcn
    186 2231
    [26] Lee SK Wang H Law SH et al Analysis of the 16S23S rDNA
    intergenic spacers (IGSs) of marine vibrios for speciesspecific
    signature DNA sequences[J] Marine Pollution Bulletin 2002
    44(5) 412420
    [27] Wei J Zhou XM Xing D et al Rapid and sensitive detection of
    Vibrio parahaemolyticus in sea foods by
    electrochemiluminescence polymerase chain reaction method[J]
    Food Chemistry 2010 123(3) 852858
    [28] Klein SL West CKG Mejia DM et al Genes similar to the Vibrio
    parahaemolyticus virulencerelated genes tdh tlh and vscC2
    occur in other Vibrionaceae species isolated from a pristine
    estuary[J] Applied and Environmental Microbiology 2014
    80(2) 595602
    [29] West CKG Klein SL Lovell CR High frequency of virulence
    factor genes tdh trh and tlh in Vibrio parahaemolyticus strains
    isolated from a pristine estuary[J] Applied and Environmental
    Microbiology 2013 79(7) 22472252
    [30] Rosec JP Simon M Causse V et al Detection of total and
    pathogenic Vibrio parahaemolyticus in shellfish comparison of
    PCR protocols using pR72H or toxR targets with a culture
    method[J] International Journal of Food Microbiology 2009
    129(2) 136145
    [31] Alaboudi AR Ababneh M Osaili TM et al Detection
    identification and prevalence of pathogenic Vibrio
    parahaemolyticus in fish and coastal environment in Jordan[J]
    Journal of Food Science 2016 81(1) M130M134
    [32] Weng QY Zhang JM Zhu F et al Analysis of the pathogenic
    characteristics of Vibrio parahaemolyticus from foodpoisoning in
    Xiamen city from 2005 to 2011[J] China Modern Medicine
    2014 21(19) 48 (in Chinese)
    翁琴云 张建梅 朱滏 等 2005–2011 年厦门市食物中毒副溶
    血性弧菌病原特征分析[J] 中国代医药 2014 21(19) 48
    [33] Lin X Chen ZH Weng QY et al Application of multiplex
    realtime PCR technique to detect Vibrio parahaemolyticus and
    its virulence genes[J] Chinese Journal of Health Laboratory
    Technology 2015 25(6) 870872 (in Chinese)
    林雪 陈泽辉 翁琴云 等 应重实时荧光 PCR 方法检测
    副溶血性弧菌毒力基[J] 中国卫生检验杂志 2015
    25(6) 870872
    [34] Zhang J Li ZJ Wang Y et al A preliminary study on molecular
    typing method for Vibrio parahaemolyticus based on molecular
    motor biosensor[J] Microbiology China 2013 40(7) 12791289
    (in Chinese)
    张捷 李兆杰 王煜 等 基分子马达生物传感器技术副
    溶血性弧菌分子分型方法初步研究[J] 微生物学通报 2013
    40(7) 12791289
    [35] Jiang YH Tan GL Chen YB et al Simultaneous detection of
    three foodborne bacterial pathogens by mutiplex PCR[J]
    Guangdong Agricultural Sciences 2011 38(10) 135137 (in
    Chinese)
    江迎鸿 谭贵良 陈亚波 等 重 PCR 方法检测食品中霍乱
    弧菌副溶血性弧菌单核细胞增生李斯特氏菌[J] 广东农业
    科学 2011 38(10) 135137
    [36] Lee N Kwon KY Oh SK et al A multiplex PCR assay for
    simultaneous detection of Escherichia coli O157 H7 Bacillus
    cereus Vibrio parahaemolyticus Salmonella spp Listeria
    monocytogenes and Staphylococcus aureus in Korean
    ReadytoEat Food[J] Foodborne Pathogens and Disease 2014
    11(7) 574580
    [37] Zhang ZH Xiao LL Lou Y et al Development of a multiplex
    realtime PCR method for simultaneous detection of Vibrio
    parahaemolyticus Listeria monocytogenes and Salmonella spp in
    raw shrimp[J] Food Control 2015 51 3136
    [38] Turner JW Malayil L Guadagnoli D et al Detection of Vibrio
    parahaemolyticus Vibrio vulnificus and Vibrio cholerae with
    respect to seasonal fluctuations in temperature and plankton
    abundance[J] Environmental Microbiology 2014 16(4)
    10191028
    [39] GarridoMaestu A Chapela MJ Peñaranda E et al Inhouse
    validation of novel multiplex realtime PCR gene combination for
    the simultaneous detection of the main human pathogenic vibrios
    (Vibrio cholerae Vibrio parahaemolyticus and Vibrio
    vulnificus)[J] Food Control 2014 37 371379
    [40] Zhang ZH Liu HQ Lou Y et al Quantifying viable Vibrio
    parahaemolyticus and Listeria monocytogenes simultaneously in
    raw shrimp[J] Applied Microbiology and Biotechnology 2015
    99(15) 64516462
    [41] Vinothkumar K Bhardwaj AK Ramamurthy T et al Triplex PCR
    assay for the rapid identification of 3 major Vibrio species Vibrio
    cholerae Vibrio parahaemolyticus and Vibrio fluvialis[J]
    Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 2013 76(4)
    526528


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